보훈의학연구소

1) 유전자은행자동화시스템(Automated liquid handler & DNA extraction system)

바이오뱅킹에 필요한 일련의 처리과정을 수행할 수 있는 장비로, 자동으로 혈액에서 버피코트를 인지하여 추출할 수 있는 장비와 핵산을 추출해 주는 장비로 구성되어 있습니다.

• 제조사 : TECAN
• 모델 : Freedom EVO 200/150
• 규격
  • Freedom EVO 200 for buffycoat extraction
    1. 8 Channel Liquid Handler
    2. Robotic Arm
    3. Barcode reader for blood tube
    4. Barcode reader for storage tube
    5. Tip carrier and waste
    6. Tube carrier
    7. Microplate carrier
    8. Tube capper and decapper
    (Samplosopher cap 96s fully automatic)
  • Freedom EVO 150 for DNA extraction
    1. 8 Channel Liquid Handler
    2. Robotic Arm
    3. Microplate thermo shaker
    4. Vacuum module
    5. Magnetic plate
    6. Barcode reader for storage tube
    7. Tip carrier and waste
    8. Tube carrier

2) 차세대염기서열분석기(Next Generation Sequencing)

자동으로 대용량의 염기서열 분석과 해석이 가능하며, 타겟 DNA, Transcriptome, 타겟 RNA, 엑솜 염기서열분석 등 보편적인 다양한 NGS 애플리케이션을 지원합니다.

• 제조사 : Thermofisher Scientific
• 모델 : Ion S5 XL System
• 규격

3) 고속 마이크로어레이 분석기(High-Throughput Array Plates System)

하나의 플랫폼으로 Genotyping 연구, 유전자 발현 분석, Splice variant 분석, GWAS 연구 등 다양한 유전체연구에 적용할 수 있는 시스템입니다.

• 제조사 : Thermofisher Scientific
• 모델 : GeneTitan
• 규격
  • 1. Complete GeneTitan MC Instrument with integrated hybridization oven, fluidics processing, and imaging device
    2. Computer workstation with monitor
    3. External barcode reader
    4. Uninterruptible power supply for 220V
    5. GeneChip Command Console Software

4) 고성능 유세포 분석기(High-performance Flow Cytometer)

최신의 자동화된 고성능 유세포분석기로서 세포들의 표현형 분석에 사용하며, 면역학, 세포생리학, 종양학 등 다양한 분야에서 실험할 수 있는 장비입니다.

• 제조사 : Becton Dickinson
• 모델 : BD FACSCelesta
• 규격
  • 1. High-performance Flow Cytometry Sensor System Includes Laser Bench with Vis. 488 / 405 / 640nm Laser and Optics with 14-Detectors System.
    2. Automated Fluidics Supply System with Workstation & FACSDiVa Software and Standard Accessories System.
    3. System Controls, Cytometer Setup and Tracking (CS&T) Beads.

5) 라이브셀 자동이미징시스템(Cell Imaging Multi-mode Reader)

명시야 및 위상차 모드로 세포의 형태 확인이 가능하며, DAPI, GFP, RF, Texas Red의 형광 필터가 구비되어 있어 다양한 형광이미징이 가능합니다. 또한 장비 내 세포배양이 가능하기 때문에 살아있는 세포의 변화를 모니터링하는데 적합한 장비입니다.

• 제조사 : BioTek Instruments, Inc.
• 모델 : Cytation 5
• 규격
  • 1. 이미지 측정 모드: 형광, 명시야, 위상차, 컬러 명시야
    2. 플레이트 리더: 형광 (monochromator), 흡광 (monochromator), 발광 측정
    3. 사용 플레이트 타입: 6-1536 well plate (plate reading: 6-384 well), culture dish (35mm, 60 mm), slide glass, chamber slide, T-25 flask
    4. 배율: 4x, 10x, 20x, 40x, 60x objectives
    5. 형광필터: DAPI, GFP, RFP, Texas Red
    6. 가스 조절: CO₂control(0-20%), O₂control(1-19%)
    7. 온도 조절: up to 65°C(응결 방지 기능 탑재)
    8. 오토포커스: Image-based autofocus, Laser autofocus
    9. 스테이지 조절: Joystick, software control
    10. 이미지 분석 소프트웨어 Gen5 포함

6) 분광형 공초점 레이저 고속 주사현미경(Spectral Confocal Laser Resonant Scanning Microscope)

일반 현미경으로는 관찰이 힘든 조직과 세포 내부를 세세하고 입체적으로 관찰할 수 있으며, 고해상도의 3차원 영상 구현이 가능한 현미경입니다.

• 제조사 : Olympus
• 모델 : FV3000RS
• 규격
  • 1. Laser Module – 405/488/561/640 nm Full Diode Laser
    2. Detection Module – independent 2channel Multi-Alkali PMT, 2channel GaAsP PMT, 1 transmission channel (DIC)
    3. Scanning Module - (Image Resolution) : 64 x 64 to 4096 x 4096 pixels
    4. Scan Speed : 16 frames/sec at 512 x 512 with Galvo scanner.
    438 frames/sec at 512 x 32 with Resonant scanner.
    5. Motorized & Inverted Microscope IX83
    6. Software Time Lapse, 3D Imaging, Sequential Scan, FRET Analysis
    7. Digital Imaging System

7) 멀티플렉스 어낼라이저(Multiplex Analyzer)

여러 종류의 단백질 또는 핵산을 한꺼번에 빠르고 정밀하게 분석할 수 있습니다. 본 시스템에는 bead-based 및 non-bead based를 모두 적용할 수 있어, 실험자의 패널 선택의 폭이 넓습니다. 또한 최대 100개의 타겟 물질을 최소 25ul 샘플량으로 96well plate에서 분석할 수 있습니다.

• 제조사 : Luminex Corp
• 모델 : Luminex 200 System
• 규격
  • 1. xPONENT® 3.1 소1프트웨어
    2. Lasers/ APDs/ PMTs 광학장치
    3. Flow Cytometry-based (유세포분석방식차용)
    4. Magnetic 및 nonmagnetic beads 적용
    5. 최대 100 Multiplex 실험가능
    6. 96 well plate 사용/ 40 분당/96-well plate를 reading
    7. 단백질 및 핵산 분석
    8. 3.5 logs dynamic range

8) 초정밀정량유전자증폭기(Digital PCR)

디지털 PCR은 Real-time PCR에 비해 약 1,000배 높은 민감도를 가지고 있고, 특히 copy number가 적은 샘플 (5,000 copies/μl 이하의 시료, 1 copy resolution)에서도 높은 정확도를 나타냅니다. 또한 Standard curve가 필요없이 쉽게 샘플의 절대정량이 가능합니다.

• 제조사 : JNMedsys
• 모델 : Clarity dPCR
• 규격
  • 1. 반응 볼륨 : 15 μl/tube
    2. 시스템 사용 환경 : 0~70°C; 95%상대 습도, 비응축 조건
    3. 리액션 반응당 파티션 수 : 10,000개
    4. 파티션 볼륨 : 1.5 nl
    5. 사용 가능한 튜브 : 8 strip-Tube
    6. 튜브 용량 : 0.2 ml
    7. 유전자 증폭기 : 램프 속도 조절이 가능하며, 0.2ml 튜브를 사용할 수 있는 히팅 블럭
    8. 판독기 처리량 : 1회당 32개
    9. 멀티 검출 채널 개수 : 2-colours(FAM과 HEX/VIC)
    10. 광원 : LED
    11. 검출 모드 : End point
    12. 리더 인터페이스 : USB 또는 Ethernet

9) 멀티오믹스 질량분석기(Multiomics Mass Spectrometer)

진화된 사중극자 기술과 고성능 오비트랩 기술을 결합시킨 고분해능 하이브리드 질량분석 시스템으로서 단백체학과 대사체학에 있어 높은 신뢰성을 가진 정성분석 및 정량분석이 가능한 시스템입니다.

• 제조사 : Thermofisher Scientific
• 모델 : Q Exactive Plus
• 규격
  • 고분해능 질량분석기
    1. 하이브리드 사중극자-오비트랩 질량분석기
    2. 질량 분해능 : ≥280,000 (FWHM)
    3. 질량 정확도 : 내부기준물 조정 없이 ≤3 ppm RMS
    4. 감도 : S/N ≥100:1 @ 30 fg Buspirone on column
    5. 질량 범위 : m/z 50 ~ 6,000
    6. 스캔 사이클 속도 : 고분해능 스캔으로 모든 스캔에 대하여 초당 12번(12Hz) 이상
    7. 극성 전환 기능 : 실험 중 1초 이내에 one full positive 와 one full negative scan 수행
    8. 나노분무 이온소스 : 온라인 컬럼 30℃ ~ 60℃ 가열 가능
  • 고속분리 액체크로마토그래피
    1. 압력 범위 : ≥900 bar (15,000 psi)
    2. 용매 라인 개수 : 6개 중 2개 이상 선택 사용
    3. 용매 탈기 : 탑재형, 2개 이상의 채널
    4. 컬럼온도 조절 : 5 °C ~ 120 °C
    5. 자동시료주입장치 시료주입 정밀도 : <0.25% RSD at 1 μL, caffeine in water
  • 나노분리 액체크로마토그래피
    1. 유속 범위
    - HPG 나노 펌프 : 20 nL/min ~ 50 µL/min
    - LPG 마이크로 펌프 : 10 ~ 2500 μL/min
    2. 압력 범위 : 2 ~ 80 MPa (11,600 psi, HPG nano pump)
    3. 머무름 시간 재현성 : ≤0.2% RSD @ 300 nL/min gradient mode
    4. 컬럼온도 조절 : 5 °C ~ 110 °C
    5. 자동시료주입장치 시료량 : 3 x 24 deep well plates

10) 슬라이드 스캐너 (자동조직 스캔 & 이미징 시스템)

1. 자동 디지털 형광 현미경을 통하여 세포 분화, 단백질 발현, 세포 독성과 같은 세포와 조직 내 반응을 확인할 수 있습니다. (Hematoxylin & Eosin stain 샘플 뿐만 아니라 형광 dye를 사용한 샘플도 측정 가능)

2. 이미징 시스템은 고강도 LED 광원 및 필터 큐브, 옵티칼 필터, 고품질의 렌즈로 구성되어 있으며, 자동 초점기능(autofocus) 기능을 포함하여 현미경의 모든 시스템을 소프트웨어를 통해 조절할 수 있습니다.

• 제조사 : BioTek Instruments Inc.
• 모델 : LionHeartFX
• 규격
  • 1. 이미징 모드 : 형광, 명시야, 위상차 및 Color brightfiled
    2. 광원 : High power, user-replaceable LEDs or Halogen
    3. 카메라 : 16-bit gray scale CCD camera
    4. 필터 큐브 장착 개수 : 4개 이상 장착 가능
    5. 렌즈 장착 개수 : 6개 이상 장착 가능
    6. 대물렌즈 : 4x, 10x, 20x, 40x, 60x, 60x(oil)
    7. 이미지 측정 rate (single well fastest frame rate) : 2x2 binning : 초당 20 frames까지 (single color images)
    8. 해상도 : 0.3 um/pixel at 20x, 0.15 um/pixel at 40x, 0.075 um/pixel at 60x
    9. 자동화 기능 : Autofocus, user-trained autofocus, auto exposure, auto-LED intensity, auto-XY stage
    10. 포지션 컨트롤 : 조이스틱 or 소프트웨어
    11. 이미징 방법 : Single color, Multi color, Montage, Time Lapse, Z-stacking
    12. 이미지 프로세싱 : Stitching, Z-Projection, Digital phase contrast, Preprocessing , (Background flatting), Alignment (Movie making), Deconvolution

11) ELISpot 판독기

AID iSpot은 가장 성공적인 EliSpot/FluoroSpot 판독기입니다. AID iSpot을 사용하면 효소 및 형광(FluoroSpot) 기반 EliSpot 분석이 모두 가능합니다.

• 제조사 : AID (Advanced Imaging Devices GmbH)
• 모델 : AID Classic Reader
• 규격
  • 1. system : close auto system
    2. enzymatic/fluorescence : minimum enzymatic
    3. Camera : CCD camera (above 2 megapixels)
    4. Illumination : LED
    ① Neon-Ring LED illumination system
    Xenon Lamp (fluorescence)
    ② top light : 120 LED ring
    bottom light : High illumination, uniform flat light pannel
    5. Scanning stage
    ① Quad Pack control system
    ② 4 step image step mode
    6. Plate type : 96well plate
    7. Quality control : software QC mode
    8. Validation : GLP

12) 실시간핵산정량분석기(Q-PCR)

이 장비는 형광표지 물질인 5’Nucease assay (TaqMan Probe)와 double-strand DNA binding dye (SYBR GreenⅠ)을 응용하여 sample 내에 존재하는 target DNA/RNA 의 양을 실시간으로 측정할 수 있습니다. 특정 유전자 발현과 관련된 DNA, mRNA등의 정량 및 검색, 집단 간의 유전자 상대 발현도 비교 등 다양한 응용이 가능합니다.

• 제조사 : Thermo Scientific
• 모델 : Applied Biosystems Step One Plus Real-Time PCR System
• 규격
  • 1. 반응 well : 96 well
    2. 최대 ramp 속도 : 4.6℃/sec 또는 이상
    3. 가열 및 냉각 속도 : Fast mode : 2.2℃/sec 또는 이상
    4. 샘플 검출 : LED
    5. 검출 채널 : 4 filters 또는 이상
    6. 동적 범위 : 9 logs 또는 이상
    7. 블록 모드 : 96 well Standard

13) 유세포 분리기

AutoMACS Pro는 표적 항원과 결합할 수 있는 항체를 결합시킨 극히 작은 마이크로 입자와 전자기적 특징을 이용하여 원하는 세포를 빠르게 분리할 수 있는 기기입니다.

• 제조사 : Miltenyi Biotec.
• 모델 : AutoMACS pro
• 규격
  • 1. 전 자동화 세포분리
    ① 최대 5개 샘플까지 연속적인 자동 분리 가능
    ② 자동화 시스템으로 Hands-on-time 최소화
    2. 표준화 된 프로토콜 사용
    ① 프로그램 내장
    ② 재현성 있는 결과 도출
    ③ Target cell frequency, 항원 발현율에 따라 프로그램 선택 가능
    3. 초고속 세포 분리
    4 x 109 total cells, standard program 5분 완성
    4. 재사용 가능한 전용 column 사용
    ① 1 column 당 최대 100 test 가능
    ② capacity : 4 x 109 cells/sample
    2 x 108 magnetically labeled cells/sample
    5. Sample capacity (input) : less than 50㎖
    Sample capacity (output) : less than 52㎖

14) 실시간 핵산 정량 시스템 (Real Time PCR System)

이 장비는 형광표지 물질인 5‘ Nuclease assay(TaqMan Probe)와 Double-stranded DNA binding dye (SYBR Green I)을 응용하여 sample내에 존재하는 target DNA/RNA의 양을 실시간으로 측정함으로써, 특정 유전자 발현과 관련된 DNA, mRNA 등의 정량 및 검색, 집단 간의 유전자 상대 발현도 비교 등 다양한 응용이 가능함

• 제조사 : Roche Diagnostics
• 모델 : LightCycler®96 Instrument
• 규격
  • 1. 반응 well : 96-well 또는 동등이상
    2. 최대 Ramp 속도 : 4.4°C/sec 또는 동등이상
    3. 소모품 형태 : Plate 또는 동등이상
    4. 샘플 검출 : LED 또는 Xenon Lamp
    5. 검출 채널 : 4 filters 또는 동등이상
    6. 블록 모드 : 96-well Standard
    7. Passive reference dye
    8. Standalone (데크스탑, 노트북 등의 추가 장비를 필요로 하지 않음)

15) 실시간 떨림 유발 전환분석기 (Microplate reader)

본 장비는 신경 퇴행성 질환을 앓는 환자들의 뇌척수액에서 Alpha-synuclein이라는 파킨슨병과 연관된 단백질이 비정상적으로 축적되는 것을 검사하는 RT-Quic assay (실시간 떨림 유발 전환 실험) 분석기이다. 플레이트 용기에 담긴 형광이 표지 된 샘플을 필터방식을 이용하여 형광을 띄는 샘플의 정확한 파장을 측정할 수 있다.

• 제조사 : BMG LABTECH
• 모델 : FLUOstar Omega
• 규격
  • 1. 형광(FL, FRET), 시간 분해 형광 (TRF, TR-FRET), 발광 (LUM, BRET) 등 가능
    2. 사용 플레이트 타입: 6-에서 최대 384-well plate 까지 사용
    3. 형광 물질 파장에 적합한 필터를 사용하여 정확한 값 측정 (최대 Excitation/Emission 각 8개의 필터 장착 가능)
    - 측정 가능한 파장 범위: 240 - 740 nm
    4. 민감도
    1) 형광: FI < 0.2 fmol/well fluorescein
    2) 발광: LUM 20 amol/well ATP DLReadyTM
    3) 시간분해형광: TRF < 30 amol/well europium
    High-end TRF for Omega < 3 amol/well europium
    5. 시간별 측정 및 엔드 포인트 측정 가능
    6. 분석 소프트웨어 제공 (Linear regression, 4- and 5-parameter, Hyperbola, Segmental regression, Cubic spline, 2nd and 3rd polynomial, EC50, IC50, r2 값 등 결과 획득 용이)
    7. 제논 플래시 램프
    8. 온도 조절 제어 : +4°C above ambient up to 65°C

16) 라이브러리 품질정량장치 (전자동전기영동장치)

핵산(DNAs, RNAs)의 광범위한 분석을 위한 자동화 장비로 기존의 매뉴얼 방식을 최소화하고 제품화된 시약을 사용하여 누구나 재현성 있는 결과를 얻어낼 수 있습니다.

• 제조사 : Agilent
• 모델 : 4200 TapeStation system
• 규격
  • 1. 1회 시료량 : 96시료 (90분)
    2. 시료 최소 볼륨
    ① DNA : 2㎕
    ② RNA : 6㎕
    3. 시료의 변성도 분석 수치
    ① DNA : DNA의 변성 정도 측정 기준치 제공 DIN(DNA integrity number), GQS(Genomic DNA Quality Score)
    ② RNA : RNA의 변성 정도 측정 기준치 제공 RIN (RNA integrity number), RQS (RNA Quality Score)
    4. DNA 분석 ScreenTape 또는 Chip kit 종류
    ① DNA 1000 basepair 분석 kit : 35 ~ 1,000 bp
    ② DNA 5000 basepair 분석 kit : 1,000 ~ 5,000 bp
    ③ High Sensitivity DNA 분석 kit : 100 ~ 5,000 bp
    ④ Genomic DNA 분석 kit : 200 ~ 40,000 bp
    5. RNA 분석 ScreenTape 또는 Chip kit 종류
    ① RNA 5,000 nucleotide 분석 kit : 100 ~ 6,000 nt
    6. Barcode Reader(Plate)가 Barcode를 인식하여 plate 단위의 샘플 관리 효율을 극대화.
    7. RFTaq 기술을 적용하여, 소모품의 교체 주기 관리가 편리 또는 소모품주기 소프트웨어상 확인 가능.
    8. Detector는 PCR dye 영역과 파장 간섭 없는 재현성 보유.
    9. 온도 조절 장치가 있어 외부 온도 변화에 무관하며 재현성을 확보

17) 대용량자동전기영동장치 (자동화 전기영동장치)

완전 자동화 시스템으로서 Ready-to-run 키트를 이용한 자동화 전기영동 장치로 DNA, RNA 를 분자량에 따라 분리하는 장치입니다. Total RNA, mRNA, miRNA의 단편들의 비율, 농도, 순도를 분석 할 수 있으며, cRNA/cDNA 또는 일정 크기로 절단된 RNA/DNA의 질적 분석이 가능하여 유전적 profile 스크리닝, RFLP, AFLP, 유전자발현, 바이러스/박테리아 DNA 검사 등의 여러 실험방법에 응용됩니다.

• 제조사 : QIAGEN
• 모델 : QIAxcel Advanced System
• 규격
  • 1. 샘플 처리 능력 : 1-96 시료 또는 이상
    2. 분석 감도 : 0.1ng/㎕ 또는 이상
    3. 해상도 : < 3-7bp 또는 이상
    4. 분석에 필요한 최소 양 : 1 ㎕ 또는 이상
    5. 분석시료 소비량 : 0.1㎕ 또는 이상
    6. 동시에 분석할 수 있는 채널 수 : 12 채널 또는 이상
    7. 검출한계 : 15bp-10kb 또는 이상, RNA 100-6,000nt 또는 이상
    8. 분석시간(12 시료기준) : 3~10분 또는 이상
    9. 광원 : LED(light-emitting diodes) 또는 laser